הנהגת איילון היא הנהגה מרחבית, הפועלת באזור שבין רמלה לשוהם. במרחב ההנהגה קיימים 16 שבטים הפזורים בערים וביישובים: מודיעין-מכבים-רעות, לפיד, שוהם, רמלה, לוד, בית אריה ונעלה. בעיר מודיעין פועלים שלושה שבטים דתיים, המקיימים פעילות צופית ייחודית המותאמת לאורח החיים ולערכי הקהילות בהן הם פועלים.
ההנהגה מחנכת ברוח ערכי תנועת הצופים, ושואפת ליצור טוב משותף בין שבטי ההנהגה ובין הקהילות המקומיות. עשייתה החינוכית מבוססת על חינוך ערכי וחווייתי, על טיפוח תחושת שייכות ומרחב בטוח לכלל החניכים והחניכות, ועל חיזוק מקומו של השבט כגורם משמעותי בקהילה, המטפח מנהיגות צעירה ומעורבות חברתית.
את העשייה ההנהגתית מוביל צוות בוגרים ובוגרות, שכירים ומתנדבים, שעברו הכשרות, הדרכות והסמכות מקצועיות. הצוות פועל מתוך מחויבות עמוקה לערכי התנועה ולחניכיה. לצד הצוות פועלת גם קומונה של חברי וחברות שנת שירות, הפעילה בערים רמלה ולוד, ומהווה נדבך מרכזי בעשייה החינוכית והקהילתית.